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如有神“柱”| 寡核苷酸分析利器- BIOshell™ Å120 Oligo C18熔融核色谱柱

更新时间:2026-07-22 浏览次数:24

寡核苷酸是由2-30个核苷酸残基通过磷酸二酯键连接而成的短链核酸片段,广泛用于生物治疗(包括基因治疗、RNA干扰和反义寡核苷酸疗法)而备受关注。这些化合物的治疗效果高度依赖其纯度和结构完整性,因此建立稳健的分析方法对质量控制至关重要。

 

HPLC法是监控寡核苷酸合成的关键技术,能为其纯度和结构完整性提供有价值的参考。然而,由于寡核苷酸结构复杂且存在杂质,传统的HPLC方法在分离寡核苷酸时面临挑战。提高 pH 和温度的条件会进一步增加分离难度,因为传统全孔颗粒(FPP)色谱柱的硅胶填料通常不适合此类条件。

 

BIOshell™ A120 Oligo C18色谱柱采用熔融核Fused-Core®颗粒技术,具有快速、高效的特点。表面改性的有机硅烷,具有耐碱性,在使用高pH值分离寡核苷酸时具有优异的稳定性,这项创新技术有助于开发稳健的方法,改善碱性化合物的分离效果。碱性化合物在低 pH 条件下通常峰形不佳、保留不足等问题。BIOshell色谱柱表面惰性的硬件,很好的解决了样品吸附问题,可用于生物惰性系统。

 

 

 

BIOshell Å120 Oligo C18色谱柱特点

 

· 120 Å孔径:能分离长达60个碱基的寡核苷酸

· 高pH值和高温条件下出色的稳定性:专为分离寡核苷酸而设计

· 兼容性:与UHPLC和质谱兼容的键合相

· 硬件经表面惰性处理:降低样品吸附

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· 键合相:表面修饰的二甲基十八烷基硅烷
颗粒大小: 2.7 μm

· 孔径: 120Å

· USP分类: L1

· 碳载量: 5.6%

· 表面积: 75m2/g

· 是否封端: 是

· 柱温(低pH): 2/90 °C,柱温(高pH): 9/85 °C

 

对比实验

与全多孔色谱柱相比,BIOshell A120 Oligo C18柱在分离寡核苷酸方面表现出更优异的性能。如下图,在高pH条件下,BIOshell A120 Oligo C18和其他供应商的寡核苷酸色谱柱分离不同长度的寡核苷酸混合物。在对比色谱柱上,由于全多孔色谱柱色谱柱扩散路径增加,全多孔色谱柱峰形较差,20个碱基及以上的低聚物出现拖尾。由于BIOshell Fused-Core®颗粒色谱柱的快速和高柱效,相同样品在BIOshell™色谱柱上无拖尾。

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出峰顺序:1.10 mer ,2. 15 mer, 3, 20 mer, 4. 25 mer ,5. 30 mer, 6. 40 mer ,7. 50 mer, 8. 60 mer

 

色谱条件:

色谱柱: BIOshell A120 Oligo C18, 2.7μm, 5 cm x 2.1 mm I.D.( 70003-U)

对比柱:Oligo 130A C18,1.7um,2.1*50mm

流动相A:100mM TEAA, pH 8.5

流动相B:乙腈

梯度时间:

Time

%B

0.0

5

10.0

11

11.0

11

11.5

0

16.5

0

流速:0.5 mL/min

背压:BIOshell™140 bar, 对比柱255bar

柱温:60 °C

进样体积:1.0 μL

样品溶剂:10mM Tris HCl/1mM EDTA

检测波长:UV/PDA, 254 nm

流通池:1 μL

采集频率100 Hz

响应时间0.025 s

 

 

 

长寡核苷酸的分离:

寡核苷酸的分离:从20mer - 到100mer

 

使用BIOshellA120 Oligo C18 INERTProve色谱柱可以实现单链DNA(ssDNA)寡聚体的分离。如示例所示,这些色谱柱成功分离100-mer的寡核苷酸,展示了其精度和效率,以及处理复杂且长序列的能力。

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分离寡核苷酸混合物

在高pH条件下使用BIOshell A120 Oligo C18色谱柱,可以在5分钟内分离出含有6种不同寡核苷酸的样品。

IMG_260 

出峰顺序:1.20 mer, 2. 15 mer ,3.12 mer ,4. 25 mer, 5. 33 mer, 6. 12 mer

 

色谱条件:

色谱柱:BIOshell™ A120 Oligo C18, 2.7μm, 5 cm x 2.1 mm I.D.(70003-U)

流动相A:100mM TEAA, pH 8.5

流动相B:乙腈

梯度时间:

时间

%B

0

7.5

5

15

5.3

60

5.6

60

8.0

7.5

流速:0.4 mL/min

背压:142 bar

柱温:50 °C

进样体积:1 μL of Oligonucleotide Performance Standard Mix, 12-33 NT

样品溶剂:10mM Tris HCl/1mM EDTA

检测波长:PDA, 254 nm

流通池:1 μL

采集频率:100 Hz

相应时间:0.05 sec.

 

 

 

分离不同大小寡核苷酸

以下是分离寡核苷酸标准混合物(含有10-60个ssDNA)的应用。使用了乙酸三乙胺(TEAA)和乙腈梯度洗脱。在3.5分钟内,使用BIOshell™ A120 Oligo C18, 2.7μm, 5 cm x 2.1 mm I.D.( 70003-U),可分离长达60个碱基的寡核苷酸,并获得优异的峰型和分离。

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出峰顺序:1.10 mer ,2. 15 mer, 3, 20 mer, 4. 25 mer ,5. 30 mer ,6 .40 mer ,7 .50 mer ,8. 60 mer

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优异的批间重现性

使用4个不同批次的色谱柱,对含10-60个不同长度碱基的单链DNA样品进行分析。

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出峰顺序:1. 10 mer, 2. 15 mer ,3. 20 mer ,4. 25 mer ,5. 30 mer ,6. 40 mer ,7. 50 mer ,8. 60 mer

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